ИИ научился искать лекарства в 1200 раз быстрее современных систем
Исследователи Массачусетского технологического института разработали модель глубокого обучения EquiBind, которая в 1200 раз быстрее аналогов связывает молекулы с белками при создании лекарств.
Перед началом разработки лекарства исследователи должны сперва найти молекулы, способные «состыковываться» с определенными белками-мишенями. Однако этот процесс требует значительных финансовых и вычислительных средств. Более того, на разработку и тестирование нового лекарства уходят десятки лет, а 90% открытий терпят неудачу, заявили ученые.
По словам ведущего автора исследования Ханнеса Штарка, существующие методы связывания лиганда с белком напоминают «попытки вставить ключ в замок с большим количеством замочных скважин».
«Типичные модели отнимают много времени и оценивают каждое “соответствие”, прежде чем выбрать лучший вариант. Напротив, EquiBind напрямую предсказывает точное расположение ключа за один шаг без предварительного знания целевого кармана белка, что известно как “слепая стыковка”», — заявил ученый.
По словам исследователей, модель имеет встроенные геометрические рассуждения, которые помогают ей изучать основную физику молекул и делать более точные прогнозы при столкновении с новыми, неизвестными данными.
Директор по данным биотехнической компании Relay Therapeutics Пэт Уолтерс предложил ученым испытать систему на существующем лекарстве и белке, используемых в лечении рака легких, лейкемии и опухолях желудочно-кишечного тракта. По его словам, алгоритм успешно связал лиганды с белками, чего не удалось сделать традиционными методами.
«EquiBind предлагает уникальное решение проблемы стыковки, которое включает в себя как предсказание позы, так и идентификацию места привязки», — говорит Уолтерс.
Исследователи планируют представить алгоритм на Международной конференции по машинному обучению. Штарк заявил, что команда намерена собрать больше отзывов о системе от специалистов в отрасли, чтобы улучшить ее.
Напомним, в марте алгоритм искусственного интеллекта вывел более 40 000 вариантов химического оружия за шесть часов.
В ноябре 2021 года холдинг Alphabet основал новую компанию для поиска лекарств с помощью ИИ.
В июле искусственный интеллект от DeepMind смоделировал 20 000 белковых структур человека.
Подписывайтесь на новости ForkLog в Telegram: ForkLog AI — все новости из мира ИИ!